El Consejo General del Instituto Nacional Electoral (INE) aprobó el plan integral y el calendario de coordinación para el proceso electoral extraordinario en los municipios de Chiapas; El Parral, Emiliano Zapata, Frontera Comalapa, Honduras de la Sierra, Siltepec y Venustiano Carranza, y confía en que haya condiciones de seguridad para el desarrollo de las actividades a partir del 1 de febrero en cada uno de los territorios para los comicios del 3 de abril y la toma de posesión de quienes resulten electos el 1 de junio de este año.
En los municipios de Honduras de la Sierra, Venustiano Carranza y Siltepec, no se realizaron elecciones el 6 de junio del 2021 cuando se eligieron miembros de ayuntamientos y diputados locales, debido a diversos actos de violencia, lo que ocasionó que se dieran de baja a las casillas que se instalarían en dichos municipios, en estos casos no se presentaron impugnaciones.
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En el municipio de El Parral, no fue posible realizar el cómputo municipal derivado de la quema de 12 paquetes electorales y la cancelación de tres paquetes más, por lo tanto, el 17 de julio del 2021, el Tribunal Electoral del Estado de Chiapas mediante resolución TEECH/JIM-M/2021, declaró la nulidad de la elección y confirmó la determinación de invalidez y de la no expedición de la constancia de mayoría y validez efectuada por el consejo municipal electoral correspondiente.
Por lo que respecta al municipio de Emiliano Zapata, se desarrolló la jornada electoral del 6 de junio, sin embargo, en la etapa de escrutinio y cómputo en las casillas hubo actos de violencia y quema de boletas electorales, por lo que toda la paquetería fue siniestrada, por ende, el cómputo municipal no fue realizado, en tanto el 10 de agosto del 2021, la Sala regional Xalapa del Tribunal Electoral del Poder Judicial de la Federación en sentencia SX-JRC-231/2021 y SX-JDC-1329/2021, confirmó la nulidad de la elección.
En el municipio de Frontera Comalapa, el Tribunal Electoral del Estado de Chiapas resolvió el expediente TEECH/JIM-M/002/2021, y acumulados, determinando la nulidad de la elección por hechos violentos que afectaron el desarrollo de la jornada electoral del 6 de junio, dicha resolución fue confirmada por la Sala Regional del Tribunal Electoral del Poder Judicial de la Federación.
El 30 de septiembre del 2021 la Comisión Permanente del Congreso del Estado emitió acta que contiene los decretos 433, 434, 435, 436, 437 y 438 mediante las que designó concejo municipal en cada uno de los seis municipios para entrar el funciones desde el 1 de octubre del 2021, sin embargo, el 22 de noviembre el Tribunal Electoral del Estado de Chiapas determinó modificar los decretos y ordenó al Congreso del Estado convocar a elecciones extraordinarias y este lo hizo desde el 7 de diciembre para que el proceso electoral comience el 1 de febrero venidero por parte del Instituto de Elecciones y Participación Ciudadana.